V oficiálních materiálech USAF je uvedeno, že generál Jacob Carter zemřel, po dlouhém boji s nemocí, na rakovinu. Jeho tělo bylo spáleno a popel se všemi poctami rozprášen, dle jeho přání. Pohřbu se účastnili generálmajor George Hammond, Jacobova dcera major Samantha Carterová několik blízkých rodinných přátel.
Neoficiálně se Jacob Carter stal hostitelem Tok'ry Selmak, poté co jeho dcera zjistila, že mu zbývá nanejvýš pár měsíců života. Toto spojení mu zajistilo vyléčení vleklé choroby a prodloužení života až na 200 let, po dvou letech však umírá na jedový toxin vylučuvaný tok’rou ( tok’ra zkolabovala a zemřela , Jacob s ní ).
V současné době je Jacob Carter jedním z hlavních vyjednavačů mezi Tok'ry a Zemí (SGC).